Os jogos InterUNESP foram inicialmente criados pela Reitoria da Universidade em meados dos anos 70 e eram chamados de “Jogos Unesp”. No final da década de 90, mais precisamente em 1998, a reitoria suspendeu os “Jogos Unesp” por motivos até então desconhecidos. Durante dois anos não houve a realização dos jogos. Já no ano de 2000 foi fundada a Liga InterUNESP de Esportes Universitários, composta por membros das Atléticas de alguns campi. Este foi o maior marco na história do InterUNESP!

Desde então o evento é organizado por alunos da UNESP, desde a escolha da empresa de festas até a forma de como serão as disputas. As Atléticas se responsabilizam ainda pela organização de cada campus, desde a venda dos pacotes de festa até a organização do alojamento na cidade sede e, é claro, na formação das equipes que a representarão nas disputas.

Hoje participam 22 campi (Araçatuba, Araraquara, Assis, Bauru, Botucatu, Dracena, Franca, Guaratinguetá, Ilha Solteira, Itapeva, Jaboticabal, Marília, Ourinhos, Presidente Prudente, Registro, Rio Claro, Rosana, São José do Rio Preto, São José dos Campos, São Vicente, Sorocaba e Tupã) separados em duas divisões, sendo a primeira com 12 participantes e a segunda com 10. A permuta ocorre entre os dois primeiros colocados da Segunda Divisão com os dois últimos da Primeira Divisão no ano seguinte.

O InterUNESP tem como principal objetivo promover a prática esportiva dentro das unidades, incentivando os estudantes a treinarem e praticarem regularmente atividades esportivas. Apesar de se tratar de uma competição esportiva, fora das quadras, o InterUNESP se caracteriza pela enorme união e integração entre os alunos. Por isso é o evento mais esperado do ano.

A escolha da cidade que sediará os Jogos é feita através de uma eleição onde as Atléticas interessadas apresentam sua candidatura de cidade sede. São apresentadas à Liga toda a infra-estrutura para a realização dos jogos e então é feita uma eleição onde cada Atlética possui voto.

As cidades que já sediaram os Jogos: Botucatu(2001), Araraquara(2002), Guaratinguetá (2003), Jaboticabal(2004), Ilha Solteira(2005), Araraquara(2006), Franca(2007) ,Rio Claro (2008), Assis(2009), Araraquara(2010) e Marília(2011).

São disputados jogos de diversas modalidades em que os atletas devem estar regularmente matriculados e em dia com a instituição que representa. Os Jogos são realizados em quadras cedidas pela prefeitura da cidade sede, assim como os locais de alojamento que geralmente são em escolas municipais e estaduais.